Star Trek: Armada II (2001)
Il Quadrante Alfa è di nuovo nel caos: i Borg sono sopravvissuti all'esplosione della particella Omega e i Cardassiani cercano vendetta. In questo RTS, la gestione delle risorse si divide tra metallo e latinum, a meno che non si guidi la Specie 8472, capace di convertire tutto in biomateria. Le battaglie sfruttano ora l'asse verticale per spostare le navi e posizionare le stazioni su diverse altezze. Si colonizzano pianeti per reclutare equipaggi più velocemente e si potenziano i sistemi vitali delle flotte nel finale della partita. Tre campagne guidano la Federazione, i Klingon e i Borg attraverso l'astio intergalattico.